小型船舶操縦士の免許を取得方法には
大きく分けて2通りあるようです。
(1) 国家試験受験コース
(2)教習所コース(国家試験免除講習)
(詳しくは、Wikipedia などで)

私は船や海のことは経験が浅いので
(2)の方で取得してみようと思います。

インターネットでJEISというところに受講を予約してみたら
早速、申込書類を送っていただきました。

1級小型船舶操縦士 受講申込書類

1.指定された受講申込書へ記入します。
2.住民票(本籍地記載)を取得します。
3.証明写真(縦4.5cm×横3.5cm)を4枚用意します。
4.身体検査証明書は医療機関で受診し、医師に記入していただきます。
5.受講料は指定の振替用紙を使って、郵便局からお支払いします。
  (振替払込請求書 兼 受領書のコピーを添付します)
必要書類が揃ったら郵送します。

後日、学科・実技講習で使う教本が送られてくるそうです。